25 октября 1991 года образована таможенная служба России

Указом Президента РСФСР от 25 октября 1991 года № 161 в целях обеспечения экономической основы суверенитета и государственной безопасности РСФСР, защиты интересов народа Российской Федерации образован Государственный таможенный комитет РСФСР.

В 1992 году число таможенных учреждений увеличилось с 200 до 400, а численность сотрудников таможенных органов возросла с 8 до 18,5 тысяч человек.

В 1993 году ГТК России наметил на ближайшую перспективу пять приоритетных программ развития таможенного дела:

- обустройство границы и создание таможенной инфраструктуры;

- создание эффективной системы таможенных платежей;

- формирование таможенной статистики внешней торговли;

- кадровое обеспечение и социальное развитие таможенной службы;

- компьютеризация таможенных органов и их техническое оснащение.

Пересмотрена структура центрального аппарата, в который вошли Главный научный информационно - вычислительный центр, Российская таможенная академия с  Институтом повышения квалификации и переподготовки работников таможенных учреждений, Центральная таможенная лаборатория и ряд государственных предприятий. Создано 12 региональных управлений.

В 1994 году функционируют уже 127 таможен и 413 таможенных постов, в таможенной службе работает 30 тысяч таможенников. На внутренние воды страны выходят таможенные суда.

В 2004 году Указом Президента РФ от 09.03.2004 № 314 «О системе и структуре федеральных органов исполнительной власти» ГТК России преобразован в Федеральную таможенную службу (ФТС России).

На сегодняшний день в структуре российской таможенной службы 8 региональных таможенных управлений, 70 таможен, 482 таможенных поста, штатная численность таможенных органов составляет порядка 61 тысячи человек.

Российская таможня сегодня – важная часть экономического потенциала страны. Её миссия - работать в интересах общества и экономической безопасности государства, максимально способствовать привлечению в страну масштабных инвестиций, созданию высокоэффективных рабочих мест и развитию международного сотрудничества.